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Thèse

• Manuscrit de thèse

Authored

• Mareschal, Palau et al, Blood Adv. 2021
• Mareschal et al, Bioinformatics 2017
• Mareschal et al, JID 2017
• Mareschal et al, GCC 2015
• Mareschal, Ruminy et al, JMD 2015
• Mareschal et al, Bioinformatics 2014
• Mareschal et al, Haematologica 2011

As main contributor

• Dubois et al, Oncotarget 2015
• Bohers et al, Leuk Lymphoma 2014
• Bohers et al, GCC 2014
• Lanic et al, Leuk Lymphoma 2012

Attended with an oral communication

• Mareschal et al, ISMB/ECCB 2023
• Mareschal et al, PMC 2018
• Mareschal et al, JED NBISE 2015
• Mareschal et al, CNO 2014
• Mareschal et al, SFH 2014

Attended with a poster

• Mareschal, Julia et al, ISMB/ECCB 2023
• Mareschal et al, ISMB/ECCB 2015
• Mareschal et al, CNO 2015
• Mareschal et al, IRIB 2015
• Mareschal et al, AACR 2015
• Mareschal et al, ECCB 2014
• Mareschal et al, ISMB/ECCB 2013
• Mareschal, GRR 2012
• Mareschal et al, IFRMP23 2010

Attended

• GAP 2018
• ESH 2017
• CNO 2013
• CNO 2012

Websites

• Centre Henri Becquerel

Internet emissions

• Les RDV du Lymphome - Projet Digi-Lymph
• Les RDV du Lymphome - Projet CAMELEON

Contributed papers

• Carras et al, JCI 2021
• Viailly et al, BMC Bioinformatics 2021
• Hayette et al, Hemasphere 2021
• Österroos et al, BCJ 2020
• Anande et al, CCR 2020
• Dubois et al, EBM 2019
• Hornung et al, Sci Rep 2018
• Bobée et al, JMD 2017
• Fontanilles et al, Oncotarget 2017
• Huet et al, BCJ 2017
• Dubois et al, CCR 2016
• Rizzo et al, AJH 2016
• Jardin et al, AJH 2016
• Camus et al, Haematologica 2016
• Bouzelfen et al, Leuk Res 2016
• Stamatoullas et al, BMT 2016
• Cottereau et al, CCR 2016
• Camus et al, Leuk Lymphoma 2016
• Dubois et al, CCR 2016
• Stamatoullas et al, Leuk Lymphoma 2015
• Ghesquieres et al, JCO 2015
• Ruminy et al, Leukemia 2015
• Stamatoullas et al, BJH 2015
• Bohers et al, Haematologica 2015
• Alcantara et al, EJNMMI 2014
• Clatot et al, Oral Oncol 2014
• Lanic et al, Leuk Lymphoma 2013
• Bertrand et al, GCC 2013
• Jardin et al, Leuk Lymphoma 2013
• Guney et al, GCC 2012
• Ruminy et al, Leukemia 2011

Oral communications

• Jardin et al, ICML 2017
• Fontanilles et al, ASH 2015
• Jardin et al, ASH 2015
• Dubois et al, ICML 2015
• Jardin et al, ICML 2015
• Ruminy et al, ASH 2013
• Jardin et al, ICML 2013
• Ruminy et al, ASH 2012
• Jardin et al, ASH 2012
• Etancelin et al, SFH 2012
• Ruminy et al, SFH 2012
• Lanic et al, EHA 2011

Posters (main contributor)

• Viailly et al, ISMB/ECCB 2015
• Dubois et al, SOHO 2014
• Dubois et al, ASHLB 2014
• Gouerant et al, ESMO 2012

Performed

• Formation au langage R
• Cours de CGH Array (M2)
• Cours de génétique somatique (M1)
• Cours de génétique somatique (M1)
• Cours de CGH Array (M2)

Attended

• ChIP-seq data analysis
• Introduction to NGS - RNA-seq course
• Genetic Diseases - GWAS and WES
• Ion data analysis essentials
• Mener un projet de recherche
• Développer son réseau professionnel
• TOIEC

Experiences

• Stage au CEA

R packages

• FSAtools
• Rgb
• cghRA
• LPS
• rawFasta (deprecated)
• ODB

R functions

• promptRefClass()
• moveColumn()
• srv()
• swap()
• Bitmap images

Scripts

• plotIonogram
• blast2sam

• Upstream quality control
• Read trimming and filtering
• Alignment to the reference genome
• Peak calling
• Downstream quality control
• Differential binding analysis
• Functional annotation and analysis

Course presentation available on the course webpage